基础与转化医学研究所成立于2012年10月。

研究所在学校人事政策的大力支持下，研究所吸引了一批优秀人才，造就了一支学术研究力量雄厚的师资队伍。截至2024年11月，共有各类科研工作人员61人，其中教授3人，副教授6人；具有博士学位教师46人，硕士学位教师10人。其中全国优秀创新创业导师1人，省中青年科技创新领军人才2人，省高校青年杰出人才2人，省科技新星2人，校级高层次引进人才1人，校振兴人才3人。现有科研团队9个，主要研究方向分别为：神经退行性疾病发病机制研究、动脉粥样硬化性血管病机制、血管功能与血管性痴呆发病机制研究、肿瘤的分子机制与治疗药物筛选、疾病诊疗功能性材料研究、炎症性疾病与免疫治疗、创新药物与天然活性成分开发、生化分析与分子诊断。

研究所经过多年的建设，逐步建成了完善的科学研究平台。现有省级重点实验室2个、市级重点实验室1个、院士工作站1个、国际科技合作基地1个，省级工程研究中心1个，分别为：陕西省缺血性心血管疾病重点实验室、陕西省脑疾病防治重点实验室、西安市常见老龄疾病防治重点实验室、陈志南院士工作站、西安靶向生物医药国际科技合作基地、重大脑疾病药物开发陕西省高校工程研发中心。科研平台使用面积900余平方米，仪器设备900台（件），总值达1500余万元。实验平台设有分子生物学实验室、细胞培养室、免疫组化室、药物研究室、药物分析室、神经电生理室和SPF级别的动物实验中心。

优秀的师资队伍依托良好的科研平台开创了良好的科研局面，并取得了丰硕的成果。研究所承担各类科研基金项目共200余项，总经费1500余万元，其中：国家自然科学基金27项，省部级项目40余项，经费1200余万元。发表SCI论文100余篇，其中近5年有多篇文章发表在NCB、AM、ACS Nano等国际著名学术期刊，最高影响因子25.807。授权国家发明专利15项，实用新型专利25项。获批陕西省科学技术一等奖1项，二等奖1项；陕西省自然科学优秀学术论文二等奖1项，三等奖2项；“沣东杯” 陕西科技工作者创新创业大赛获奖3项。通过与公司开发合作项目、专利转让、技术转让等方式共获得资助经费260万元。现获批陕西省科技创新团队1个和陕西省高校青年创新团队3个。分别为：陕西高校青年创新团队--脑重大疾病机制及转化医学创新团队、动脉粥样硬化性心血管疾病转化研究团队、医用功能化生物大分子材料研究与转化创新团队。

研究所积极与国内外高校在科学研究等方面开展合作，依托合作院校开展教师访学、学术报告、合作科研，全面提升研究所科学研究质量。为落实科技成果转化策略，广泛与省内外多个生物医药企业开展合作，加快科技成果转化进程。